分子古生物學原理與方法

《中國科學院研究生教學叢書》序
前言
第1章 DNA與分子古生物學
引言
1?1 歷史回顧
1?2 一些基本概念
1?3 分子進化型式
1?4 分子系統(tǒng)學概要
1?5 分子系統(tǒng)學在古生物學中的意義
1?6 附錄
第2章 群體遺傳動力學
引言
2?1 等位基因頻率的變化
2?2 自然選擇
2?3 隨機遺傳漂變
2?4 有效居群規(guī)模
2?5 基因替代
2?6 在突變壓力下等位基因的消失
2?7 基因多態(tài)性
2?8 新達爾文理論和中性突變假設(shè)
第3章 古DNA的研究方法與應用
引言
3?1 研究簡史
3?2 古DNA研究的意義及難點
3?3 基本概念與方法
3?4 實驗技術(shù)
3?5 古DNA序列分析及可靠性鑒別方法
3?6 古DNA的應用
3?7 結(jié)語
3?8 附錄:古DNA實驗要點
第4章 古氨基酸研究
引言
4?1 氨基酸立體化學基礎(chǔ)
4?2 技術(shù)和方法
4?3 化石氨基酸及其外消旋作用的一些應用
4?4 附錄
第5章 生物標志物及其古生物與古環(huán)境意義
引言
5?1 生物標志物的定義與特點
5?2 研究簡史
5?3 有機化學預備知識
5?4 生物標志物的地球化學
5?5 生物標志物在古氣候古環(huán)境研究中的應用
5?6 生物標志化合物的地史分布
5?7 附錄:生物標志物的分析技術(shù)
第6章 分子數(shù)據(jù)的基本處理方法――以DAMBE分析軟件為例
引言
6?1 分子數(shù)據(jù)文件的格式及格式轉(zhuǎn)換
6?2 在互聯(lián)網(wǎng)(Internet)上獲取數(shù)據(jù)
6?3 GenBank數(shù)據(jù)文件的內(nèi)涵與處理方法
6?4 多序列對位排列(Multiple Alignment)
6?5 分子序列數(shù)據(jù)的基本分析方法
6?6 氨基酸頻率及其演化
6?7 附錄
第7章 分子譜系樹的構(gòu)建與檢驗
引言
7?1 基本概念、模型與分析流程
7?2 分子譜系樹的構(gòu)建
7?3 分子譜系樹的統(tǒng)計檢驗
7?4 附錄:網(wǎng)絡(luò)資源
第8章 中性理論、分子鐘及支系分歧時間估算
引言
8?1 中性理論:分子進化速率研究的理論基礎(chǔ)
8?2 分子鐘
8?3 譜系間的速率差異
8?4 關(guān)于分子鐘的爭議
8?5 研究實例:后生動物門類的起源
8?6 展望
第9章 非線性分子進化與古生物重大事件
引言
9?1 進化研究從形態(tài)至分子、從線性至非線性
9?2 非線性分子進化研究簡史
9?3 非線性分子進化的機制
9?4 非線性進化研究方法
9?5 三葉蟲興衰的呼吸機制探秘
9?6 結(jié)語
參考文獻
名詞索引