放線菌系統(tǒng)學(xué)：原理、方法及實(shí)踐

前言
第一篇 放線菌系統(tǒng)學(xué)原理及實(shí)驗方法
第一章 概論
　　1.1 放線菌在微生物系統(tǒng)學(xué)中的地位
　　1.2 放線菌生物學(xué)的發(fā)展
　　1.3 放線菌生物技術(shù)的發(fā)展
　　1.4 放線菌資源的開發(fā)與利用
　　主要參考文獻(xiàn)
　第二章 放線菌系統(tǒng)分類學(xué)的過去和現(xiàn)在
　　2.1 國外概況
　　2.2 國內(nèi)概況
　　2.3 幾個值得重視的問題
　　主要參考文獻(xiàn)
　第三章 形態(tài)特征和培養(yǎng)特征在分類中的意義
　　3.1 放線菌的基本形態(tài)
　　3.2 放線菌形態(tài)特征和培養(yǎng)特征的穩(wěn)定性
　　3.3 形態(tài)分化的分子機(jī)制
　　主要參考文獻(xiàn)
　第四章 生理生化特性
　　4.1 生理生化實(shí)驗的內(nèi)容
　　4.2 實(shí)驗方法
　　4.3 API細(xì)菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)
　　4.4 Biolog全自動和手動細(xì)菌鑒定系統(tǒng)
　　主要參考文獻(xiàn)
　第五章 化學(xué)分類原理
　　5.1 細(xì)胞壁化學(xué)類型
　　5.2 全細(xì)胞水解物糖類型
　　5.3 磷酸類脂分析
　　5.4 醌組分分析
　　5.5 枝菌酸分析
　　5.6 脂肪酸分析
　　5.7 全細(xì)胞蛋白SDS-PAGE分析
　　5.8 核糖體蛋白雙向凝膠電泳(2D-IPAGE)分析　
　　主要參考文獻(xiàn)
　第六章 分子系統(tǒng)學(xué)原理及方法
　　6.1 核酸的提取、分離與純化
　　6.2 聚合酶鏈反應(yīng)
　　6.3 凝膠電泳技術(shù)
　　6.4 16S rRNA基因序列分析
　　6.5 DNA(G+C)mol％測定
　　6.6 DNA同源性分析
　　6.7 RNA同源性分析
　　6.8 DNA分子指紋分析
　　6.9 DNA探針及其應(yīng)用
　　6.10 特異性引物應(yīng)用于菌株的快速鑒別
　　主要參考文獻(xiàn)
　第七章 生物信息學(xué)在放線菌系統(tǒng)學(xué)中的應(yīng)用
　　7.1 提交序列到數(shù)據(jù)庫
　　7.2 16S rRNA系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
　　7.3 RNA二級結(jié)構(gòu)分析在分類學(xué)中的應(yīng)用
　　主要參考文獻(xiàn)
　第八章 多相分類
　　8.1 種的概念
　　8.2 屬的概念
　　8.3 哪些菌株值得進(jìn)行分類鑒定
　　8.4 放線菌分類鑒定的基本程序
　　8.5 有效發(fā)表的刊物
　　8.6 如何撰寫論文
　　8.7 投稿
　　主要參考文獻(xiàn)
第二篇 各論
　第一章 放線菌在原核生物中的地位
　　1.1 放線菌綱的建立
　　1.2 放線菌門的研究進(jìn)展
　　主要參考文獻(xiàn)
　第二章 放線菌亞目
　　2.1 放線菌科及主要屬　
　　主要參考文獻(xiàn)
　第三章 丙酸桿菌亞目
　　3.1 丙酸桿菌科及主要屬
　　3.2 類諾卡氏菌科及主要屬
　　主要參考文獻(xiàn)
　第四章 微球菌亞目
　　4.1 微球菌科及各屬
　　4.2 博戈里亞湖菌科及各屬
　　4.3 短桿菌科及各屬
　　4.4 纖維單孢菌科及各屬
　　4.5 皮桿菌科及各屬
　　4.6 皮生球菌科及各屬
　　4.7 嗜皮菌科及各屬
　　4.8 間孢囊菌科及各屬
　　4.9 瓊斯氏菌科及各屬
　　4.10 微桿菌科及各屬
　　4.11 原小單孢菌科及各屬
　　4.12 稀有桿菌科及各屬
　　4.13 血桿菌科及各屬
　　4.14 閻氏菌科及各屬
　　4.15 布登堡菌科及各屬
　　主要參考文獻(xiàn)
　第五章 棒桿菌亞目
　　5.1 棒桿菌科及各屬
　　5.2 迪茨氏菌科及各屬
　　5.3 戈登氏菌科及各屬
　　5.4 分枝桿菌科及各屬
　　5.5 諾卡氏菌科及各屬
　　5.6 慢反應(yīng)脂肪酸菌科及各屬
　　5.7 冢村氏菌科及各屬
　　5.8 威廉姆斯氏菌科及各屬
　　主要參考文獻(xiàn)
　第六章 假諾卡氏菌亞目
　　6.1 假諾卡氏菌科及主要屬
　　6.2 束絲放線菌科及主要屬
　　主要參考文獻(xiàn)
　第七章 鏈霉菌亞目
　　7.1 鏈霉菌科及主要屬　
　　主要參考文獻(xiàn)
　第八章 鏈孢囊菌亞目
　　8.1 擬諾卡氏菌科及主要屬
　　8.2 鏈孢囊菌科及主要屬
　　8.3 高溫單孢菌科及主要屬　
　　主要參考文獻(xiàn)
　第九章 小單孢菌亞目
　　9.1 小單孢菌科及主要屬
　　主要參考文獻(xiàn)
　第十章 弗蘭克氏菌亞目
　　10.1 弗蘭克氏菌亞目各科的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
　　10.2 弗蘭克氏菌科及主要屬
　　10.3 嗜地皮菌科及主要屬
　　10.4 中村氏菌科及主要屬
　　10.5 魚孢菌科及主要屬
　　10.6 熱酸菌科及主要屬
　　10.7 “動孢菌科”及主要屬
　　主要參考文獻(xiàn)
　第十一章 糖霉菌亞目
　　11.1 糖霉菌科及主要屬　
　　主要參考文獻(xiàn)
　第十二章 未歸類各屬
　　12.1 雙孢放線菌屬
　　12.2 珊瑚放線菌屬
　　12.3 卓孢菌屬
　　12.4 佩爾澤氏菌屬
　　12.5 蘇黎世菌屬　
　　主要參考文獻(xiàn)
　第十三章 高溫放線菌科
　　13.1 高溫放線菌屬
　　13.2 萊斯氏屬
　　13.3 黃色高溫微桿菌屬
　　13.4 清野氏菌屬
　　13.5 直絲菌屬
　　主要參考文獻(xiàn)
附錄：放線菌科屬名錄