非編碼RNA

前言
第1章 核糖核酸調(diào)節(jié)子概述
　1.1 引言
　1.2 核糖核酸的特性
　1.3 編碼和非編碼轉(zhuǎn)錄物
　1.4 RNA調(diào)節(jié)子的功能
　1.5 展望
　參考文獻(xiàn)
第2章 內(nèi)含子和非編碼RNA：真核生物復(fù)雜性的隱含層
　2.1 引言
　2.2 非編碼RNA代表了哺乳動物及幾乎所有復(fù)雜生物基因組的主要產(chǎn)物
　2.3 內(nèi)含子和ncRNA是否代表了基因表達(dá)的第二個(gè)層次
　2.4 內(nèi)含子
　2.5 非編碼RNA
　2.6 非編碼RNA的起源和命名法
　2.7 “基因”的新定義——一個(gè)具有順式作用調(diào)節(jié)元件的轉(zhuǎn)錄集合
　2.8 涉及RNA的復(fù)雜遺傳現(xiàn)象
　2.9 RNA結(jié)合和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白
　2.10 ncRNA的可能功能
　2.11 一個(gè)新的遺傳學(xué)
　參考文獻(xiàn)
第3章 基于計(jì)算發(fā)現(xiàn)非編碼RNA
　3.0 摘要
　3.1 引言
　3.2 蛋白質(zhì)編碼基因和ncRNA基因的發(fā)現(xiàn)
　3.3 用戶定制的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)程序
　3.4 可重新配置的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)程序
　3.5 從頭開始的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)——在沒有序列或結(jié)構(gòu)先驗(yàn)知識的情況下尋找基因
　3.6 ncRNA基因預(yù)測程序的現(xiàn)狀與展望
　致謝
　參考文獻(xiàn)
第4章 Xist RNA與染色質(zhì)結(jié)合并導(dǎo)致基因沉默
　4.0 摘要
　4.1 引言
　4.2 Xist基因
　4.3 胚胎中Xist介導(dǎo)基因沉默的起始
　4.4 Xist表達(dá)的調(diào)控——計(jì)數(shù)和選擇X染色體
　4.5 Xist發(fā)揮功能的機(jī)制
　4.6 一種Xist功能模型
　4.7 關(guān)于進(jìn)化的思考
　4.8 結(jié)語
　參考文獻(xiàn)
第5章 果蠅中的劑量補(bǔ)償作用：核蛋白體復(fù)合物介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄上調(diào)
　5.1 概述
　5.2 劑量補(bǔ)償作用的不同機(jī)制
　5.3 劑量補(bǔ)償作用的基本原則
　5.4 通過染色質(zhì)修飾的雄性特異的高轉(zhuǎn)錄
　5.5 雄性特異劑量補(bǔ)償實(shí)現(xiàn)依賴于性別致死抑制子的缺失
　5.6 DCC的組成
　5.7 roX RNA是染色質(zhì)進(jìn)入位點(diǎn)
　5.8 DCC的有序組裝
　5.9 MSL蛋白的特殊功能以及它們之間的相互作用
　5.10 roX RNA是劑量補(bǔ)償所必需的
　5.11 模型和展望
　參考文獻(xiàn)
第6章 H19印跡RNA的結(jié)構(gòu)、調(diào)節(jié)和功能
　6.0 摘要
　6.1 引言
　6.2 調(diào)節(jié)性RNA
　6.3 H19的印跡
　6.4 H19的組織特異性表達(dá)
　6.5 H19的保守序列
　6.6 H19與生長控制
　6.7 H19 RNA是否有功能？
　參考文獻(xiàn)
第7章 microRNA
　7.0 摘要
　7.1 引言
　7.2 miRNA的發(fā)現(xiàn)和分離
　7.3 miRNA的特征
　7.4 lin-4的作用機(jī)制
　7.5 參與miRNA產(chǎn)生與功能的蛋白質(zhì)
　7.6 尋找miRNA的靶位點(diǎn)
　7.7 人工miRNA
　7.8 結(jié)語
　參考文獻(xiàn)
第8章 siRNA和miRNA：微小，但是強(qiáng)大
　8.0 摘要
　8.1 micoRNA
　8.2 小干擾RNA
　8.3 siRNA引發(fā)RNAi的應(yīng)用
　參考文獻(xiàn)
第9章 植物中的轉(zhuǎn)錄后基因沉默
　9.0 摘要
　9.1 引言
　9.2 多條途徑產(chǎn)生雙鏈RNA起始植物PTGS
　9.3 從dsRNA到RNA降解途徑的沉默模型
　9.4 PTGS在植物中的作用
　9.5 結(jié)論
　參考文獻(xiàn)
第10章 RNA指導(dǎo)的DNA甲基化及染色質(zhì)修飾
　10.0 摘要
　10.1 引言
　10.2 同源依賴的基因沉默
　10.3 RNA指導(dǎo)的DNA甲基化(RdDM)現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)及其特征
　10.4 RdDM的分子機(jī)制
　10.5 RNA指導(dǎo)的染色質(zhì)修飾
　10.6 RNA沉默的進(jìn)化機(jī)制
　10.7 展望
　致謝
　參考文獻(xiàn)
第11章 腦特異的非信使RNA
　11.0 摘要
　11.1 引言
　11.2 腦內(nèi)的大分子nmRNA
　11.3 腦內(nèi)的snmRNA
　11.4 展望
　致謝
　參考文獻(xiàn)
第12章 snoRNA世界的新領(lǐng)域
　12.0 摘要
　12.1 引言
　12.2 修飾指導(dǎo)snoRNA的兩大家族
　12.3 snoRNP的生成
　12.4 指導(dǎo)snRNA修飾的新snoRNA
　12.5 尋找RNA靶點(diǎn)時(shí)發(fā)現(xiàn)的孤兒snoRNA
　12.6 腦特異的印跡snoRNA
　12.7 修飾指導(dǎo)snoRNA的古菌同源物
　12.8 古菌tRNA同樣是靶點(diǎn)
　12.9 結(jié)語
　致謝
　補(bǔ)充證據(jù)
　參考文獻(xiàn)
第13章 植物細(xì)胞中非編碼RNA或短可讀框編碼RNA研究的新進(jìn)展
　13.0 摘要
　13.1 存在于植物和動物中沒有長ORF的mRNA
　13.2 僅含有sORF的mRNA參與植物的生長和發(fā)育
　13.3 作用的可能機(jī)制
　13.4 展望：小調(diào)控RNA和sORF編碼的寡肽作為新基因表達(dá)調(diào)控子
　參考文獻(xiàn)
第14章 發(fā)育活化和應(yīng)激誘導(dǎo)的非編碼黑腹果蠅hsrw基因整合其他核轉(zhuǎn)錄物的翻譯后加工　
　14.0 摘要
　14.1 引言
　14.2 果蠅中93D或入hsrw基因表現(xiàn)出獨(dú)特和保守的可誘導(dǎo)性，但顯然不產(chǎn)生蛋白質(zhì)　
　14.3 果蠅中入hsrw基因具有獨(dú)特的保守結(jié)構(gòu)，卻很少有堿基序列保守
　14.4 hsrw基因產(chǎn)生多個(gè)非編碼轉(zhuǎn)錄物
　14.5 hsrw基因在發(fā)育過程中廣泛表達(dá)
　14.6 hsrw基因啟動子區(qū)是復(fù)合體
　14.7 盡管是非編碼轉(zhuǎn)錄物，hsrw是有功能的
　14.8 hsrw轉(zhuǎn)錄物的功能
　14.9 未來展望
　致謝
　參考文獻(xiàn)
第15章 adapt基因的RNA轉(zhuǎn)錄物作為核糖核酸調(diào)節(jié)子
　15.0 摘要
　15.1 背景
　15.2 adapt15和adapt33的鑒定
　15.3 adapt15和adapt33的作用機(jī)制
　15.4 結(jié)語
　參考文獻(xiàn)
第16章 顯性非編碼微衛(wèi)星擴(kuò)展紊亂中RNA的致病機(jī)制
　16.0 摘要
　16.1 引言
　16.2 Ⅰ型肌強(qiáng)直性營養(yǎng)不良：基因的發(fā)現(xiàn)和致病模型的提出
　16.3 8型脊髓小腦共濟(jì)失調(diào)
　16.4 10型脊髓小腦共濟(jì)失調(diào)
　16.5 DM1、SCA8和SCA10之間臨床和分子上的差別
　16.6 Ⅱ型肌強(qiáng)直性營養(yǎng)不良
　16.7 肌強(qiáng)直性營養(yǎng)不良中RNA的致病機(jī)制
　16.8 其他非編碼擴(kuò)展失調(diào)
　16.9 總結(jié)
　參考文獻(xiàn)
第17章 由細(xì)菌染色體編碼的非編碼RNA
　17.0 摘要
　17.1 概述
　17.2 引言
　17.3 持家sRNA
　17.4 調(diào)控的反義RNA進(jìn)入兩種境地
　17.5 反式編碼的反義RNA MicF是一個(gè)應(yīng)激反應(yīng)的調(diào)控因子
　17.6 sRNA可以調(diào)控多個(gè)基因
　17.7 一個(gè)調(diào)控RNA——兩個(gè)(或多個(gè))靶RNA
　17.8 多個(gè)RNA作用于同一個(gè)靶
　17.9 sRNA的另一個(gè)作用：破壞同一個(gè)操縱子下的基因協(xié)調(diào)表達(dá)
　17.10 某些sRNA需要輔助蛋白
　17.11 例外(？)：E.coli染色體順式編碼反義RNA
　17.12 通過sRNA和蛋白質(zhì)間相互作用調(diào)控基因表達(dá)
　17.13 sRNA的結(jié)構(gòu)
　17.14 細(xì)胞中穩(wěn)定或不穩(wěn)定？
　17.15 初級或加工后轉(zhuǎn)錄本
　17.16 新sRNA的作用是什么？
　17.17 通過什么樣的機(jī)制發(fā)揮作用？
　17.18 有多少個(gè)sRNA？
　17.19 結(jié)論
　致謝
　參考文獻(xiàn)
第18章 我們數(shù)量眾多：非編碼調(diào)節(jié)RNA和Hfq
　18.0 摘要
　18.1 非編碼RNA
　18.2 非編碼RNA在革蘭陰性菌中的功能
　18.3 革蘭陽性細(xì)菌中非編碼RNA
　18.4 調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)子。ncRNA如何被調(diào)節(jié)？
　18.5 RNA結(jié)合蛋白Hfq與ncRNA
　18.6 Hfq的功能如何？
　18.7 Hfq如何與RNA相互作用？
　18.8 結(jié)論
　致謝
　參考文獻(xiàn)
中西文對照
索引