食品分子微生物學

第1章 緒論
1．1 食品微生物學的歷史
1．1．1 食品微生物的發(fā)現(xiàn)
1．1．2 食品微生物學的發(fā)展歷史
1．2 食品分子微生物學的發(fā)展
1．2．1 分子生物學的發(fā)展
1．2．2 食品分子微生物學發(fā)展中重要的分子生物學技術(shù)
1．3 食品分子微生物學的研究內(nèi)容與應用
1．3．1 食品微生物的分子鑒定
1．3．2 食品微生物的基因組學
1．3．3 食品微生物的群體生態(tài)分子機制
1．3．4 食品微生物的特殊存活狀態(tài)及其分子機制
1．3．5 食品微生物對脅迫環(huán)境的應激性反應
1．3．6 食品微生物的分子改良
1．3．7 食品微生物的分子檢測技術(shù)
復習思考題
參考文獻
第2章 食品微生物學常用的分子生物學技術(shù)
2．1 核酸提取技術(shù)
2．1．1 核酸的分類與存在形式
2．1．2 核酸的提取
2．1．3 核酸的檢測
2．2 聚合酶鏈式反應（PCR）技術(shù)
2．2．1 PCR技術(shù)的發(fā)展簡史
2．2．2 PCR技術(shù)的原理
2．3 分子克隆技術(shù)
2．3．1 分子克隆技術(shù)原理
2．3．2 工具酶
2．3．3 基因載體
2．3．4 基因表達系統(tǒng)
2．4 同源重組技術(shù)
2．4．1 RecA同源重組系統(tǒng)
2．4．2 RecE同源重組系統(tǒng)
2．4．3 Red同源重組系統(tǒng)
復習思考題
參考文獻
第3章 食品微生物的分子鑒定與分型
3．1 食品微生物分類方法概述
3．2 rRNA序列分析
3．2．1 16S rRNA和18S rRNA的序列分析
3．2．2 NCBI數(shù)據(jù)庫
3．3 非rRNA序列分析
3．3．1 腸桿菌基因間保守重復序列
3．3．2 規(guī)律成簇間隔短回文重復序列分析
3．3．3 內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)
3．3．4 葡萄球菌A蛋白基因
3．3．5 多位點序列分析
3．3．6 基于看家基因的弧菌鑒定法
3．4 分子分型技術(shù)
3．4．1 脈沖場凝膠電泳分析
3．4．2 限制性片段長度多態(tài)性分析
3．4．3 擴增片段長度多態(tài)性分析
3．4．4 隨機擴增多態(tài)性DNA分析
3．4．5 單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析
3．4．6 PCR電噴霧電離質(zhì)譜分型技術(shù)
3．4．7 多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復序列分析
3．4．8 不同分型方法的聯(lián)合應用
復習思考題
參考文獻
第4章 食品微生物的基因組學
4．1 基因組學的定義
4．2 食源性致病菌的基因組學
4．2．1 大腸桿菌和志賀氏菌的基因組學
4．2．2 沙門氏菌的基因組學
4．2．3 李斯特菌屬的基因組學
4．2．4 葡萄球菌的基因組學
4．2．5 致病性弧菌的基因組學
4．2．6 致病性芽孢桿菌基因組學
4．3 食品中有益菌的基因組學
4．3．1 乳酸桿菌的基因組學
4．3．2 乳酸乳球菌的基因組學
4．3．3 嗜熱鏈球菌的基因組學
4．3．4 雙歧桿菌的基因組學
復習思考題
參考文獻
第5章 食品微生物的群體生態(tài)分子機制
5．1 宏基因組
5．1．1 宏基因組的概念
5．1．2 宏基因組研究方法
5．1．3 微生物宏基因組學在食品科學研究中的應用
5．2 群體感應
5．2．1 微生物群體感應的概念
5．2．2 群體感應的分子機制
5．2．3 群體感應的生物學效應
5．2．4 群體感應干擾及其在食品質(zhì)量安全控制中的應用
5．3 基因水平轉(zhuǎn)移
5．3．1 微生物的可移動遺傳元件
5．3．2 基因水平轉(zhuǎn)移的方式與機制
5．3．3 基因水平轉(zhuǎn)移的作用與影響
復習思考題
參考文獻
第6章 食品微生物的特殊存活狀態(tài)及其分子機制
6．1 芽孢
6．1．1 芽孢的概念及特征
6．1．2 芽孢的形成及其分子機制
6．1．3 芽孢的萌發(fā)及其分子機制
6．1．4 食品中芽孢的控制方法
6．2 生物被膜
6．2．1 生物被膜的特征
6．2．2 生物被膜的形成及其分子機制
6．2．3 生物被膜的控制方法
6．2．4 生物被膜的檢測方法
6．3 活的但不可培養(yǎng)（VBNC）菌
6．3．1 VBNC菌的特征
6．3．2 食品中VBNC菌的產(chǎn)生
6．3．3 VBNC菌的復活
復習思考題
參考文獻
第7章 食品微生物對脅迫環(huán)境的應激性反應
7．1 微生物熱應激機制
7．1．1 微生物熱應激簡介
7．1．2 熱激蛋白
7．1．3 海藻糖
7．1．4 應激糖蛋白
7．2 微生物冷應激機制
7．2．1 微生物冷應激簡介
7．2．2 脂肪酸成分的改變
7．2．3 溶質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)運系統(tǒng)
7．2．4 冷激蛋白
7．3 微生物高滲透壓和干燥應激機制
7．3．1 高滲透壓和干燥對微生物的影響
7．3．2 微生物高滲透壓應激機制
7．3．3 微生物干燥應激機制
7．4 微生物酸脅迫應激機制
7．4．1 微生物酸脅迫簡介
7．4．2 改變細胞壁和細胞膜的成分
7．4．3 質(zhì)子泵
7．4．4 脫羧反應和脫氨基反應
7．4．5 改變基因表達及蛋白調(diào)控
7．4．6 熱休克蛋白對細胞酸脅迫的保護機制
7．5 微生物氧化脅迫應激機制
7．5．1 氧化脅迫簡介
7．5．2 抗氧化酶清除劑
7．5．3 非酶清除劑
7．6 微生物輻射脅迫應激機制
7．6．1 微生物輻射脅迫簡介
7．6．2 細菌對輻射脅迫的應激機制
7．6．3 真菌對輻射脅迫的應激機制
7．6．4 以極端微生物耐輻射奇球菌為例的抗輻射應激機制
7．7 微生物其他應激機制
7．7．1 營養(yǎng)脅迫
7．7．2 膽汁脅迫與應激
7．7．3 重金屬脅迫與應激
復習思考題
參考文獻
第8章 新興分子生物學技術(shù)在食品微生物中的應用
8．1 新一代測序技術(shù)
8．1．1 測序技術(shù)的歷史及第一代測序技術(shù)
8．1．2 新一代測序技術(shù)
8．1．3 新一代測序技術(shù)在食品微生物研究中的主要應用
8．2 組學技術(shù)
8．2．1 基因組學
8．2．2 轉(zhuǎn)錄組學
8．2．3 蛋白質(zhì)組學
8．3 新型基因組編輯技術(shù)
8．3．1 新型基因組編輯技術(shù)概述
8．3．2 ZFNs技術(shù)
8．3．3 TALENs技術(shù)
8．3．4 CRISPR／Cas系統(tǒng)
8．3．5 三種編輯技術(shù)的比較
復習思考題
參考文獻
第9章 食品微生物的分子改良
9．1 概述
9．2 食品微生物分子改良的基本原理
9．3 食品微生物分子改良的技術(shù)方法
9．3．1 優(yōu)良菌株的誘變選育
9．3．2 靶基因高效表達工程菌株的構(gòu)建
9．3．3 細胞表面展示技術(shù)
9．3．4 蛋白質(zhì)的體外定向分子改造
9．3．5 代謝途徑改造
9．4 食品微生物工程菌株的應用
9．4．1 食品微生物工程菌株生產(chǎn)工業(yè)原料
9．4．2 食品微生物工程菌株生產(chǎn)酶制劑
9．4．3 食品微生物工程菌株生產(chǎn)功能分子
9．4．4 食品微生物工程菌株改善發(fā)酵食品的風味與品質(zhì)
復習思考題
參考文獻
第10章 食品微生物的分子檢測技術(shù)
10．1 PCR及其拓展檢測技術(shù)
10．1．1 PCR檢測技術(shù)
10．1．2 實時熒光定量PCR檢測技術(shù)
10．1．3 核酸染料結(jié)合實時熒光定量PCR的活菌檢測技術(shù)
10．1．4 多重PCR檢測技術(shù)
10．1．5 環(huán)介導等溫擴增技術(shù)
10．2 熒光原位雜交（FISH）技術(shù)
10．2．1 FISH技術(shù)的原理
10．2．2 FISH技術(shù)的發(fā)展
10．3 酶聯(lián)免疫吸附測定（ELISA）
10．3．1 ELISA的原理
10．3．2 ELISA技術(shù)的分類與應用
10．4 生物傳感器
10．4．1 光學生物傳感器
10．4．2 電化學生物傳感器
10．4．3 壓電生物傳感器
10．5 基于噬菌體的檢測技術(shù)
10．5．1 熒光噬菌體檢測技術(shù)
10．5．2 其他噬菌體檢測技術(shù)
10．6 生物芯片檢測技術(shù)
10．6．1 微陣列芯片
10．6．2 液體芯片
復習思考題
參考文獻