高通量測序技術在選擇性剪接研究中的應用

定　價：￥45.00

作　者：	孫曉勇
出版社：	中國農業(yè)出版社
叢編項：
標　簽：	暫缺

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ISBN：	9787109235182	出版時間：	2018-01-01	包裝：
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內容簡介

　　《高通量測序技術在選擇性剪接研究中的應用》結合生物信息學課題組多年從事選擇性剪接的研究成果，系統(tǒng)闡述了高通量技術在選擇性剪接領域的應用與新進展，重點講述了分析高通量數(shù)據(jù)的軟件，包括通用軟件BioID Mapper、選擇性剪接分析識別軟件Splicing Types Anno和nagnag、可視化軟件prettycloud和pairheatmap。在此基礎上，進一步探討了通過基因芯片和高通量測序分析挖掘選擇性剪接的方法和流程，探索性地研究了與編碼區(qū)相關的NAGNAG選擇性剪接、非編碼區(qū)相關的未知轉錄本和長鏈非編碼RNA及相關的調控網(wǎng)絡。*后介紹了反向剪接產生環(huán)形RNA的新研究成果?！陡咄繙y序技術在選擇性剪接研究中的應用》以R語言作為主要分析工具，內容新穎，敘述深入淺出，適用于生物學和生物信息學及其相關專業(yè)的研究者閱讀參考。

作者簡介

暫缺《高通量測序技術在選擇性剪接研究中的應用》作者簡介

圖書目錄

前言
第1章 BioIDMapper：生物大分子編碼轉換系統(tǒng)
1．1 生物大分子編碼轉換
1．2 BioIDMapper下載資源
1．3 系統(tǒng)要求
1．4 軟件構架
1．5 功能簡介
1．6 圖形用戶界面
1．7 實例
1．8 項目分析
1．9 用戶使用統(tǒng)計
1．10 結論
第2章 SplicingTypesAnno：選擇性剪接識別軟件
2．1 選擇性剪接軟件
2．2 SplicingTypesAnno下載資源
2．3 系統(tǒng)安裝
2．4 主要剪接類型
2．5 單個基因分析和全轉錄組分析
2．6 輸入輸出格式
2．7 功能描述
2．8 項目分析
2．9 總結報告
2．10 用戶使用統(tǒng)計
2．11 結論
第3章 nagnag：NAGNAG選擇性剪接識別及定量軟件
3．1 NAGNAG選擇性剪接進展
3．2 nagnag下載資源
3．3 輸入輸出格式
3．4 功能描述
3．5 項目分析
3．6 用戶使用統(tǒng)計
3．7 結論
第4章 prettycloud：文本數(shù)據(jù)的可視化工具
4．1 文本數(shù)據(jù)的可視化
4．2 prettycloud下載資源
4．3 安裝
4．4 prettycloud算法
4．5 相關參數(shù)
4．6 實例
4．7 用戶使用統(tǒng)計
4．8 結論
第5章 pairheatmap：高通量數(shù)據(jù)可視化工具
5．1 熱圖
5．2 pairheatmap下載資源
5．3 相關參數(shù)
5．4 高通量測序數(shù)據(jù)分析
5．5 用戶使用統(tǒng)計
5．6 結論
第6章基因芯片分析挖掘表達差異基因
6．1 基因芯片技術
6．2 數(shù)據(jù)分析流程
6．3 項目分析
6．4 結論
第7章高通量測序RNA-seq數(shù)據(jù)分析挖掘
7．1 高通量測序
7．2 高通量測序分析流程
7．3 高通量轉錄組測序研究領域
第8章 NAGNAG選擇性剪接研究
8．1 NAGNAG選擇性剪接
8．2 研究方法
8．3 結果分析
8．4 結論
第9章轉錄非編碼區(qū)的識別和分析挖掘
9．1 轉錄非編碼區(qū)研究進展
9．2 材料與方法
9．3 結果與分析
9．4 結論
第10章長鏈非編碼RNA的識別和定量
10．1 長鏈非編碼RNA
10．2 研究方法
10．3 項目分析
10．4 結論
第11章基因調控網(wǎng)絡構建及分析
11．1 基因調控網(wǎng)絡
11．2 材料與方法
11．3 結果
11．4 基因調控網(wǎng)絡可視化
11．5 結論
第12章環(huán)形RNA的識別和定量
12．1 國內外研究現(xiàn)狀及分析
12．2 研究方法
12．3 分析流程
12．4 項目分析
12．5 結論
主要參考文獻