《基因論》全面闡述了摩爾根的染色體遺傳理論,其內容包括遺傳學的基本原理、遺傳的機制、突變的起源、染色體畸變、基因和染色體在性別決定方面的作用等。本書不但總結了摩爾根小組自己的遺傳研究成果,而且對當時已經發(fā)現(xiàn)的重要遺傳學現(xiàn)象都做出了解釋,是孟德爾—摩爾根學派觀點的系統(tǒng)展現(xiàn),其理論是遺傳學發(fā)展史上的一次大飛躍。現(xiàn)代遺傳理論是基于具有一種或多種不同性狀的兩個個體雜交得出的數(shù)據(jù)推演出的。該理論主要研究個體間呈現(xiàn)出來的遺傳單位代際分布情況。正如化學家假定存在看不見的原子、物理學家假定存在看不見的電子一樣,遺傳學者也假定存在看不見的基本元素,并將其稱為基因。這一類比成立的關鍵在于,他們都是從定量化的數(shù)據(jù)中得出結論。這些理論得以成立的前提在于,它們能夠幫助我們做出某種基于定量化數(shù)據(jù)的預測。在這種意義上,基因理論與以往生物學理論的區(qū)別在于,雖然以往的生物學理論也假定存在看不見的基本單位,但它認為這些單位的性質是任意的,基因理論則以定量化數(shù)據(jù)為唯一依據(jù)來指定基因單位的性質。