功能蛋白質(zhì)研究（第二版）

目錄
**章 緒論 1
**節(jié) 功能蛋白質(zhì)研究的歷史回顧 1
第二節(jié) 功能蛋白質(zhì)研究的主要內(nèi)容及方法 7
第三節(jié) 功能蛋白質(zhì)研究的挑戰(zhàn)和展望 12
參考文獻 13
第二章 蛋白質(zhì)組：蛋白質(zhì)的檢測 15
**節(jié) 蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)類別 15
第二節(jié) 基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)鑒定 23
第三節(jié) 基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組定量 32
第四節(jié) 人類蛋白質(zhì)組計劃 46
第五節(jié) 蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物 61
參考文獻 67
第三章 蛋白質(zhì)的生成 77
**節(jié) 翻譯過程中各組分的組學(xué)測定 77
第二節(jié) 蛋白質(zhì)的翻譯中折疊 98
第三節(jié) 翻譯調(diào)控與細(xì)胞功能 111
第四節(jié) 新蛋白的發(fā)現(xiàn)與功能 126
第五節(jié) 翻譯異常與解救機制 133
參考文獻 145
第四章 蛋白質(zhì)的質(zhì)量控制 157
**節(jié) 分子伴侶系統(tǒng) 159
第二節(jié) 蛋白質(zhì)質(zhì)量控制--內(nèi)質(zhì)網(wǎng) 165
第三節(jié) 蛋白質(zhì)質(zhì)量控制--線粒體 173
第四節(jié) 泛素與蛋白酶體 177
第五節(jié) 自噬-溶酶體途徑相關(guān)的蛋白質(zhì)降解 185
第六節(jié) 蛋白質(zhì)質(zhì)量控制相關(guān)疾病及分子機制 187
第七節(jié) 靶向蛋白質(zhì)質(zhì)量控制的*新療法 190
參考文獻 193
第五章 細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的定位研究 198
**節(jié) 細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的分選信號 198
第二節(jié) 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號和蛋白質(zhì)運輸 211
第三節(jié) 高爾基體定位蛋白的分選和逆向運輸 220
第四節(jié) 溶酶體相關(guān)的定位與功能 229
第五節(jié) 細(xì)胞外的蛋白質(zhì)分選和運輸 240
第六節(jié) 蛋白質(zhì)定位的研究方法 248
參考文獻 259
第六章 蛋白質(zhì)的功能調(diào)節(jié) 278
**節(jié) pH和水環(huán)境對蛋白質(zhì)功能的調(diào)節(jié) 278
第二節(jié) 溫度對蛋白質(zhì)功能的調(diào)節(jié) 283
第三節(jié) 蛋白質(zhì)的翻譯后修飾 289
第四節(jié) 磷酸化修飾對蛋白質(zhì)功能的調(diào)節(jié) 291
第五節(jié) ?；揎棇Φ鞍踪|(zhì)功能的調(diào)節(jié) 305
第六節(jié) 糖基化修飾對蛋白質(zhì)功能的調(diào)節(jié) 308
第七節(jié) 泛素化修飾對蛋白質(zhì)功能的調(diào)節(jié) 317
第八節(jié) 類泛素相關(guān)修飾物對蛋白質(zhì)功能的調(diào)節(jié) 322
第九節(jié) 小泛素相關(guān)修飾物對蛋白質(zhì)功能的調(diào)節(jié) 329
第十節(jié) 蛋白質(zhì)前體激活 334
參考文獻 339
第七章 蛋白質(zhì)相互作用研究 343
**節(jié) 蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)學(xué)基礎(chǔ) 343
第二節(jié) 酵母雙雜交技術(shù) 353
第三節(jié) 免疫共沉淀技術(shù) 361
第四節(jié) GST融合蛋白沉降技術(shù) 365
第五節(jié) 串聯(lián)親和純化 371
第六節(jié) 熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù) 379
第七節(jié) 交聯(lián)技術(shù) 387
第八節(jié) 預(yù)測蛋白質(zhì)相互作用的生物信息學(xué)方法 397
第九節(jié) 蛋白質(zhì)相互作用功能意義的研究策略 410
參考文獻 411
第八章 蛋白質(zhì)與核酸的互作 420
**節(jié) 核酸結(jié)合蛋白的功能與分類 420
第二節(jié) DNA結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu) 422
第三節(jié) RNA識別的一般方式 427
第四節(jié) 序列特異性結(jié)合 430
第五節(jié) 蛋白質(zhì)與核酸相互作用的研究技術(shù) 431
參考文獻 443
第九章 基因編輯技術(shù)及其在功能蛋白質(zhì)研究中的應(yīng)用 446
**節(jié) 基因編輯技術(shù)概述及開發(fā)現(xiàn)狀 446
第二節(jié) 鋅指核酸酶 450
第三節(jié) 轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶 455
第四節(jié) 成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列及其相關(guān)核酸酶 458
第五節(jié) 堿基編輯 470
第六節(jié) 基因編輯技術(shù)面臨的挑戰(zhàn)及發(fā)展 477
參考文獻 485
第十章 蛋白質(zhì)功能的生物信息學(xué)分析 497
**節(jié) 蛋白質(zhì)功能預(yù)測 498
第二節(jié) 蛋白質(zhì)功能注釋 523
第三節(jié) 蛋白質(zhì)翻譯后修飾的鑒定 541
參考文獻 573
第十一章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的研究方法 585
**節(jié) 核磁共振譜 585
第二節(jié) X射線晶體衍射 607
第三節(jié) X射線吸收光譜 617
第四節(jié) 電子順磁共振譜 623
第五節(jié) 冷凍電子顯微鏡 629
第六節(jié) 圓二色光譜 637
第七節(jié) AlphaFold預(yù)測蛋白結(jié)構(gòu) 647
第八節(jié) 分子對接和動力學(xué)模擬 664
參考文獻 679
第十二章 功能蛋白質(zhì)研究技術(shù)在生物醫(yī)藥研究中的應(yīng)用實例 691
**節(jié) 全基因組規(guī)模篩選鑒定肺癌抑癌蛋白質(zhì) 691
第二節(jié) 基于新型鄰近標(biāo)記技術(shù)的卵巢癌突變TP53蛋白質(zhì)相互作用組學(xué)研究 703
第三節(jié) 基于蛋白質(zhì)組學(xué)的抗腫瘤藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn) 720
參考文獻 727